以努爾哈赤為首領的女真族（後改滿族）在東北崛起創業，透過多年征戰統一了全中國，科爾沁蒙古部落與滿洲女真建立了結盟友好關係，也經歷了一段艱難的歷程。戰爭到和平，結盟到臣服。為大清王朝的建立，鞏固和發展做出了突出貢獻。

科爾沁是蒙古語，譯意成漢語是帶弓箭的人，也可以理解為精銳善射的蒙古部落，是成吉思汗大弟弟哈布圖哈撒爾的後裔。封地在額爾古納河和海拉爾一帶，明嘉靖年間，南下避居嫩江流域，稱為嫩江科爾沁蒙古部落，他的封地草原遼闊，水草豐美，地大物博。

莽古斯是科左中旗始祖，明安是科左後旗始祖，洪果爾是科左前旗始祖，1949 年撤銷科左前旗建制。他們三人是親兄弟，哈布圖哈撒爾的17世孫。科爾沁蒙古部經過200餘年的繁衍生息，不斷髮展，逐漸強大，成為漠南蒙古的富強部落。

科爾沁蒙古部歸順清政權經歷了兩個階段。前階段從1593 年（明萬曆21年）至1626 年（後金天聰元年），40多年是從戰爭到結盟的發展過程。後階段，後金天聰元年以後，是科爾沁部歸順滿洲併為大清王朝貢獻力量的歷史。

明朝末期北方興起兩股政治勢力，一是以林丹汗為首的蒙古察哈爾部；二是以努爾哈赤為首的滿洲部。努爾哈赤為了進攻明朝尋求支援力量，透過軍事和鬥爭逐步實施聯合蒙古科爾沁部的戰略，提高軍隊的戰鬥能力，擴大領地開疆擴土，不斷加強向外擴張的戰鬥能力。

1593 年（明萬曆21年）葉赫等部聯合蒙古三部及長白山下朱舍裡等共9部軍隊，攻打努爾哈赤，史稱9部聯軍伐滿洲。努爾哈赤率軍在古勒山（今遼寧新賓縣上夾鄉古樓村西北）開戰。9部聯軍戰敗，落荒而逃。

努爾哈赤大獲全勝之後，從科爾沁俘虜士兵中挑選20人，披錦衣騎戰馬回科爾沁家鄉，宣傳滿洲努爾哈赤的強大和富有。

1594年，滿蒙兩部關係破冰，開始交往。科爾沁蒙古部明安，送給努爾哈赤戰馬100匹，駱駝10峰。

1597 年（明萬曆25五年）滿洲與科爾沁部又發生衝突，努爾哈赤以莫須有的理由挑起事端，率領軍隊攻打科爾沁部，科爾沁蒙古軍隊奮起抵抗。兩軍開戰不分勝負而平息。

1608 年（萬曆36年）努爾哈赤命令他大兒子褚英率領軍隊，5000精兵攻打烏喇蒙古部，科爾沁蒙古出兵援助，科爾沁蒙古也曾經多次進攻滿洲。努爾哈赤對科爾沁部進行制裁，不向科爾沁蒙古部落出售弓箭。

努爾哈赤想盡辦法把科爾沁蒙古部落拉過來做自己的盟友，互派使者，往來頻繁。於是就和科爾沁等幾個蒙古部落訂立互嫁互娶，通婚友好的政策。

1614年4月，科爾沁臺吉莽古斯將女兒嫁給皇太極。

1615年正月，科爾沁洪果爾臺吉將女兒嫁給努爾哈赤。

1615年9月，科爾沁臺吉明安之子桑噶爾寨向努爾哈赤對獻戰馬30匹。

1616年（明萬曆44年，後金天命元年）12月，明安次子哈坦巴圖魯為了加強蒙滿兩部的友好關係，向努爾哈赤獻戰馬40匹。努爾哈赤用上好的盔甲錦緞，玉鐲首飾，布匹弓箭等高檔物品回饋給科爾沁蒙古部。

1617年（天命2年）2月，努爾哈赤將侄女嫁給蒙古臺吉恩格德爾。

1617年（天命2年）正月，明安率眾慶賀金國建立，努爾哈赤出京城百里列隊歡迎，獻哈達，喝下馬酒，以高規格的禮儀形式歡迎明安的到來。每天擺小宴席一次，兩天擺大宴席一次招待明安30天。

科爾沁蒙古被努爾哈赤列為重要的戰略地位，為了加強控制力度，參照滿洲八旗建制，對科爾沁蒙古部進行改組，設立蒙古八旗制直接管理。努爾哈赤對科爾沁蒙古特別小心戒備，要求四大貝勒和科爾沁蒙古臺吉們相互尊重，友好往來，和睦相處。

努爾哈赤在和親的基礎上，又透過結盟的形式將滿蒙戰略關係進一步發展和鞏固。

1624 年（天命九年）二月，努爾哈赤派遣使者前往科爾沁部落結盟通好。殺白馬黑牛，滴血飲酒。燒香跪拜，結盟互好，共同抗敵，昭告天下。互惠互利，相互利用是雙方的結盟目的，科爾沁蒙古奧巴為了借努爾哈赤之力，擺脫察哈爾部林丹汗的統治；滿州女真努爾哈赤為了解除後顧之憂，用科爾沁蒙古奧巴之力量來抵抗察哈爾部林丹汗。

1626 年（天命十年）11月，察哈爾兵進攻科爾沁蒙古部，科爾沁蒙古首領奧巴向努爾哈赤求援，皇太極率領5000騎兵前往戰場支援。察哈爾部林丹汗聞訊不戰而退。奧巴為報答努爾哈赤出兵解圍的恩情，於1627年（天命11年）5月，向努爾哈赤獻貂皮和戰馬，努爾哈赤以雕花馬鞍，優質盔甲等貴重物品回贈。

科爾沁與滿洲關係的第二階段從皇太極執政時起，得到進一步發展和鞏固，由聯盟轉變為君臣關係。

1626 年（天命11年）8月，努爾哈赤逝世，皇太極即位，他繼承父親努爾哈赤的遺志，把推翻明朝作為立國之策，為實現這一戰略目標，必須對科爾沁蒙古地區實行強化統治。因為科爾沁蒙古騎兵驍勇善戰，兇猛彪悍，戰無不勝，所以這支勁旅必定是藉助的中堅力量。

1636年（天聰10年）3月，科爾沁等6部49臺吉會集盛京（今遼寧瀋陽），皇太極設宴招待科爾沁蒙古諸王公。為了更有效地統治蒙古地區，皇太極於 1636 年（崇德元年）設立蒙古衙門，後來又把這個部門改名叫理藩院，主要行政職能就是治理科爾沁蒙古地區。同年，皇太極授權大學士希福大臣一班人到科爾沁蒙古部料理軍機事務。希福和眾大臣又把嫩江科爾沁部劃分左右兩翼，建立5個旗。科爾沁右翼建前、中、後三個旗，科爾沁左翼建前、中兩個旗，1650年又增加科爾沁左翼後旗。大清王朝實現了對科爾沁蒙古的全面統治。