本片的故事設在第二集的一年後，小嗝嗝與阿斯翠德成為博克島的新酋長後，在博克島上建立了一個輝煌又混亂的飛龍烏托邦國度，但當一隻獵龍高手葛林魔出現後，博克島再次陷入空前的危機中，為了找尋可以容納整個族人以及龍的棲身之地，小嗝嗝必須離開他們的家園...