（二）重金屬鹽沉澱蛋白質

蛋白質可以與重金屬離子如汞、鉛、銅、銀等結合成鹽沉澱，沉澱的條件以pH稍大於等電點為宜。因為此時蛋白質分子有較多的負離子易與重金屬離子結合成鹽。重金屬沉澱的蛋白質常是變性的，但若在低溫條件下，並控制重金屬離子濃度，也可用於分離製備不變性的蛋白質。

臨床上利用蛋白質能與重金屬鹽結合的這種性質，搶救誤服重金屬鹽中毒的病人，給病人口服大量蛋白質，然後用催吐劑將結合的重金屬鹽嘔吐出來解毒。

（三）生物鹼試劑以及某些酸類沉澱蛋白質

蛋白質又可與生物鹼試劑（如苦味酸、鎢酸、鞣酸）以及某些酸（如三氯醋酸、過氯酸、硝酸）結合成不溶性的鹽沉澱，沉澱的條件應當是pH小於等電點，這樣蛋白質帶正電荷易於與酸根負離子結合成鹽。

臨床血液化學分析時常利用此原理除去血液中的蛋白質，此類沉澱反應也可用於檢驗尿中蛋白質。

（四）有機溶劑沉澱蛋白質

可與水混合的有機溶劑，如酒精、甲醇、丙酮等，對水的親和力很大，能破壞蛋白質顆粒的水化膜，在等電點時使蛋白質沉澱。在常溫下，有機溶劑沉澱蛋白質往往引起變性。例如酒精消毒滅菌就是如此，但若在低溫條件下，則變性進行較緩慢，可用於分離製備各種血漿蛋白質。

（五）加熱凝固

將接近於等電點附近的蛋白質溶液加熱，可使蛋白質發生凝固（coagulation）而沉澱。加熱首先是加熱使蛋白質變性，有規則的肽鏈結構被開啟呈鬆散狀不規則的結構，分子的不對稱性增加，疏水基團暴露，進而凝聚成凝膠狀的蛋白塊。如煮熟的雞蛋，蛋黃和蛋清都凝固。