黃藥師，居住在東海的桃花島，所以也稱之為桃花島主，號東邪，為人偏激，聰明才智，無出其右，其自創了很多絕世武學，落花神劍掌，彈指神通，玉簫劍法，劈空掌，秋風掃落葉腿法，等等，五行八卦，琴棋書畫，無所不精。娶妻馮蘅，雖然不會武功，也是具有過目不忘的本領，也因此而得到半部《九陰真經》，後來因為再度默寫此書，書未成而難產而死，留下一女，黃蓉。黃蓉的故事更是不得了，可以說足足影響了射鵰三部曲。

黃藥師在第一次華山論劍前後就收了六個徒弟，陳玄風，梅超風，曲靈風，陸乘風，武眠風，馮默風，在射鵰故事開始時，陳玄風梅超風已經盜取了半部《九陰真經》逃離了桃花島，黃藥師盛怒之下，打斷剩下幾個徒弟的腿，把他們逐出了桃花島。

後來陳玄風在大漠被童年郭靖無意刺死，梅超風后也為了救師父被歐陽鋒打死，而曲靈風為了重回師門，盜取皇宮寶貝，跟大內高手同歸於盡，陸乘風在無錫也建立了歸雲莊，後來被歐陽鋒一把火燒了，其本人倒是無恙，武眠風卻是不知所蹤。至於馮默風倒是在神鵰俠侶裡出現了，曾經力敗李莫愁，後為了救郭靖，慘死在金輪法王手下。

黃藥師在晚年還收了一個孤兒程英做徒弟，書中似乎很少描述二人之間的關係。黃藥師倒是經常帶著曲靈風的遺孤女兒傻姑，行走江湖。