到了隋朝末年，天下又陷入紛爭，百姓平靜的生活又陷入水深火熱之中。群雄並起，戰爭常有發生，接踵而來的瘟疫更加頻繁。然而幸運的是，一代藥王孫思邈撐起了希望的天。孫思邈在汲取前人防治瘟疫成果的基礎上將中醫推向了另一個高度，提出了新的領域要求，他的主張是，要想更好的防治疾病，首先就得講究個人衛生同健身運動相結合，然後又適時地提出了食療、藥療的養生、養性方法。

孫思邈在隋文帝時期，天下安定，他在陝西終南山做一個不求名利的隱居道士，他即是個道士也是個傑出的醫學家，他崇尚葛洪的醫道相結合理念。他不僅僅博覽先賢醫學家所有的著作，而且非常重視民間名醫的醫療經驗，經常四處走訪，拜訪世間名醫，積累、記錄有益的治療方法，花費數載的時間，終於編著完成中國歷史上第一部臨床醫學百科全書《千金要方》，被國內外醫學者認為這一本鉅著是“人類之至寶”；同時他所著的另外一本影響深遠的百科全書《千金翼方》，這兩本偉大的著作承載中國唐朝前後的歷史，承前啟後。

中國古代的中醫幾乎都是全能的，然而孫思邈是全世界第一個提出要單獨為婦女和兒童的設科的智者，在他之後所有的著作都將婦女和兒童的醫學放在最前面，並且說這是“崇本之義”。婦女可以頂半邊天，孩子是國家的未來，所以他十分的重視婦女和兒童的疾病，以及身體保健，花費了大量的精力著有《婦人方》三卷和《少小嬰孺方》二卷，並且將這五卷，修訂在《千金藥方》的最前面。孫思邈將這個思想賦予在中醫思想之中，對於後世的醫學者影響甚深，婦女兒童疾病得以被重視。

孫思邈是非常重視和強調預防疾病的，將預防放置在所有的治療手段之前，他非常的堅持要多次辯證之後才能夠救治，他認為人們如果經常鍛鍊身體擅長養生，那麼就有很大的可能不會在得病。

孫思邈對於常見病和多發病是非常的重視，並且花費了很大的精力去研究它們。孫思邈是第一個治療大脖子病（甲狀腺腫大病）的人，他對比發現了海藻等大海中生長的植物以及動物的甲狀腺來治療這一種病具有較好的效果。“可能孫思邈有腳氣病吧”，他對於腳氣病做了非常詳細的研究以及記錄，他首先提出了用食療來預防腳氣病的方法，就是常常吃用谷白皮煮的粥，這一方法非常的親民，任何貧困的人家都可以做到，對於得了腳氣病的病人，他透過研究實驗最終選擇了含有維生素B1豐富的藥物來進行治療。他在長期的治療觀察和記錄實踐之中，總結並記錄了治療痢疾、絛蟲、夜盲症等疾病的特效藥方。

他在太白山居住的時候，常常親自外出採藥並極力的研究植物的藥性、藥理，在長期的採藥和研究藥物效能的過程中，透過記錄，辯證，最終確定了230多種藥物合適採集的時間，並記錄、編製成冊，他是第一個詳細的編制記述藥物人工種植、採摘和收藏方法，也創造了藥物學，因此後人尊稱他為“藥王”。

孫思邈也是十分的擅長針灸，他是第一個將針藥結合治病的人，提出了針灸穴位的治病方法，在長期的臨床實踐中，成功的將人體穴位彙總並繪製成彩色《明堂針灸圖》。

孫思邈是中醫歷史上第一個與朝廷全面合作的中醫，他在唐朝建立初年應詔朝廷，在朝廷的幫助下開展了一系列的醫學活動，在唐高宗四年，他在朝廷的支援下，編制鑄就了世界上第一部國家藥典《唐新本草》，這使得孫思邈的醫術、醫德、醫理在民間得到了廣泛的傳播，造福千千萬萬的百姓。孫思邈在朝廷為官的期間，在朝廷的極力的支援下，防治瘟疫這一項從上至下的體系工作，得以以最快的速度展開，基本上建立了上下相連的全面抗擊瘟疫的系統措施，唐朝也成為當時世界上最強大的國家。

孫思邈富有傳奇的診脈、施針手段：為長孫皇后治難產礙於男女有別懸絲診脈，扎一針皇后成功分娩；富有神話的奇遇藥王醫龍，曾經無意救治過涇河龍王的兒子“一條小青蛇”，對於龍王所送金銀珠寶分毫不受，只受了龍王送的三十餘種救人藥方，並記錄在《千金方》中，用以百姓；精深的針灸手段，他拯救難產假死的婦女紮了一針，是為一針兩命；施醫無類的感恩，他拯救了受傷的老虎，他居所外是一片樹林，感恩的老虎為其守護，所謂虎守杏林。

孫思邈善養生，他的樣貌與年齡不相符，沒人準確知道他是什麼時候出生的，他仙逝與公元682年，他的壽命是個謎團，最短的猜測是活了101歲，最長的有165歲，即使他活101歲，放在今天也是個長壽者。